Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC178Q5BJE1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC178Q5BJE1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC178Q5BJE1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms