Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB6CQ53S08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB6CQ53S08 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB6CQ53S08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms