Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSD17B12Q53GQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSD17B12Q53GQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms