Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPRNQ4KMQ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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