Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0F5

VPS26B, Vacuolar protein sorting-associated protein 26B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26BQ4G0F5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS26BQ4G0F5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS26BQ4G0F5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS26BQ4G0F5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms