Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf22Q49AR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C5orf22Q49AR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C5orf22Q49AR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms