Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC36A3Q495N2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC36A3Q495N2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms