Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NBPF8Q3BBV2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NBPF8Q3BBV2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NBPF8Q3BBV2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NBPF8Q3BBV2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms