Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFX4Q33E94 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFX4Q33E94 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX4Q33E94 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms