Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL38Q2WGJ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL38Q2WGJ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms