Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6V1FQ16864 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP6V1FQ16864 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1FQ16864 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1FQ16864 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1FQ16864 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1FQ16864 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1FQ16864 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1FQ16864 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP6V1FQ16864 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP6V1FQ16864 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms