Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAPC1Q16533 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAPC1Q16533 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAPC1Q16533 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms