Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERC1Q15751 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HERC1Q15751 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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