Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ALX1Q15699 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ALX1Q15699 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALX1Q15699 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALX1Q15699 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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