Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB35Q15286 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB35Q15286 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB35Q15286 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms