Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMCO1Q147U7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SMCO1Q147U7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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