Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MTMR1Q13613 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR1Q13613 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR1Q13613 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms