Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAE1Q13564 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NAE1Q13564 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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