Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXE3Q13461 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXE3Q13461 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FOXE3Q13461 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms