Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGB3BPQ13352 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB3BPQ13352 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB3BPQ13352 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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