Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1BQ13112 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1BQ13112 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHAF1BQ13112 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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