Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXD4Q12950 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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