Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 UBA1YKL210W 3075 nt5.49□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 EXG1YLR300W 1347 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 HRQ1YDR291W 3234 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 GDA1YEL042W 1557 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 YTP1YNL237W 1380 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 YDR278CYDR278C 318 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 HVG1YER039C 750 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 ECM14YHR132C 1293 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 COA1YIL157C 594 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 IMD1YAR073W 1212 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 REC114YMR133W 1287 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 YMC1YPR058W 924 nt5.48□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 TAH18YPR048W 1872 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 VTH1YIL173W 4650 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 VTH2YJL222W 4650 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 ERG1YGR175C 1491 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 CWC21YDR482C 408 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 TSR3YOR006C 942 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 MOD5YOR274W 1287 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 YBR226CYBR226C 411 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 YCK1YHR135C 1617 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 SNU71YGR013W 1863 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 YFL042CYFL042C 2025 nt5.47□□□□□ -1.53
HMS1Q12398 YET3YDL072C 612 nt5.46□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 FYV1YDR024W 486 nt5.46□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 GPI11YDR302W 660 nt5.46□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.46□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 DSF1YEL070W 1509 nt5.46□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YNR073CYNR073C 1509 nt5.46□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 VPS5YOR069W 2028 nt5.46□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 BUD9YGR041W 1644 nt5.45□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 MAK31YCR020C-A 267 nt5.45□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YGR139WYGR139W 339 nt5.45□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YIR042CYIR042C 711 nt5.45□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 FSF1YOR271C 984 nt5.45□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 POX1YGL205W 2247 nt5.45□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 TAX4YJL083W 1815 nt5.45□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 CLP1YOR250C 1338 nt5.45□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 SFB3YHR098C 2790 nt5.44□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 BNS1YGR230W 414 nt5.44□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 RDL2YOR286W 450 nt5.44□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 DAP1YPL170W 459 nt5.44□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 PFK2YMR205C 2880 nt5.44□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 MDH3YDL078C 1032 nt5.43□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.43□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.43□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YNL285WYNL285W 372 nt5.43□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 TNA1YGR260W 1605 nt5.43□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YDR015CYDR015C 240 nt5.42□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 TIF2YJL138C 1188 nt5.42□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 TIF1YKR059W 1188 nt5.42□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 RNH201YNL072W 924 nt5.42□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 SSK1YLR006C 2139 nt5.41□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 WHI2YOR043W 1461 nt5.41□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 CDC34YDR054C 888 nt5.41□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 MRPL1YDR116C 858 nt5.41□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 PHO86YJL117W 936 nt5.41□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.41□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 snR32snR32 188 nt5.41□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YAP1801YHR161C 1914 nt5.4□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 GUD1YDL238C 1470 nt5.4□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YDL218WYDL218W 954 nt5.4□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YDR396WYDR396W 501 nt5.4□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 LCP5YER127W 1074 nt5.4□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YGL235WYGL235W 537 nt5.4□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.4□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 RRS1YOR294W 612 nt5.4□□□□□ -1.54
HMS1Q12398 ICL1YER065C 1674 nt5.4□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 UTP4YDR324C 2331 nt5.4□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.39□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 ICT1YLR099C 1185 nt5.39□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 QRI5YLR204W 336 nt5.39□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 CAF40YNL288W 1122 nt5.39□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 RGT1YKL038W 3513 nt5.39□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 MDM31YHR194W 1740 nt5.39□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 BUD14YAR014C 2130 nt5.38□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 YEL068CYEL068C 333 nt5.38□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 YGR176WYGR176W 348 nt5.38□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 RHO3YIL118W 696 nt5.38□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 LDS1YAL018C 978 nt5.38□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 JNM1YMR294W 1122 nt5.38□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 CDC16YKL022C 2523 nt5.38□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 ELP3YPL086C 1674 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 TSA1YML028W 591 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 MSN2YMR037C 2115 nt5.37□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 ACS2YLR153C 2052 nt5.36□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 RAD53YPL153C 2466 nt5.36□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 YJL193WYJL193W 1209 nt5.36□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 SWP1YMR149W 861 nt5.36□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 YNL108CYNL108C 813 nt5.36□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 MRPS16YPL013C 366 nt5.36□□□□□ -1.55
HMS1Q12398 CHL4YDR254W 1377 nt5.36□□□□□ -1.55
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