Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 MAL11YGR289C 1851 nt5.09□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 YCK1YHR135C 1617 nt5.09□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 ECM14YHR132C 1293 nt5.09□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 LDS1YAL018C 978 nt5.09□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 TAE1YBR261C 699 nt5.09□□□□□ -1.59
HRD1Q08109 TAX4YJL083W 1815 nt5.09□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.08□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 TEP1YNL128W 1305 nt5.08□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 VPS4YPR173C 1314 nt5.08□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SDH4YDR178W 546 nt5.08□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.08□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 TFG2YGR005C 1203 nt5.08□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.08□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YFL042CYFL042C 2025 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 WHI2YOR043W 1461 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 RVB2YPL235W 1416 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 HST3YOR025W 1344 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 MDH3YDL078C 1032 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YGR176WYGR176W 348 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 MPC2YHR162W 390 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 TSA1YML028W 591 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YML083CYML083C 1257 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 snR32snR32 188 nt5.07□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SSK1YLR006C 2139 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 RGT1YKL038W 3513 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YTP1YNL237W 1380 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YDR187CYDR187C 519 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 AIM20YIL158W 615 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 MPM1YJL066C 759 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YKL153WYKL153W 510 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 DAP1YPL170W 459 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SFB3YHR098C 2790 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 GUD1YDL238C 1470 nt5.06□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 GDA1YEL042W 1557 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 CWC21YDR482C 408 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 EFM3YJR129C 1020 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YMR122CYMR122C 375 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YHM2YMR241W 945 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YOR111WYOR111W 699 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 MRPS16YPL013C 366 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 VPS5YOR069W 2028 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 KKQ8YKL168C 2175 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YAP1801YHR161C 1914 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 BUD14YAR014C 2130 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SNU71YGR013W 1863 nt5.05□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 CNE1YAL058W 1509 nt5.04□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 RHO3YIL118W 696 nt5.04□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YNR040WYNR040W 771 nt5.04□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 VAM7YGL212W 951 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 PHO86YJL117W 936 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 RPE1YJL121C 717 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 VPS24YKL041W 675 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 NRM1YNR009W 750 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 TFB4YPR056W 1017 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 OSW2YLR054C 2175 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YPR196WYPR196W 1413 nt5.03□□□□□ -1.6
HRD1Q08109 YEL068CYEL068C 333 nt5.02□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 TDH2YJR009C 999 nt5.02□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 APN1YKL114C 1104 nt5.02□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 SCS22YBL091C-A 528 nt5.02□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 UTP4YDR324C 2331 nt5.02□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 ERG1YGR175C 1491 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 MAK31YCR020C-A 267 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YET3YDL072C 612 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YGL072CYGL072C 360 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 HAP3YBL021C 435 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YMR252CYMR252C 405 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YBL112CYBL112C 318 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 FRS2YFL022C 1512 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 IME2YJL106W 1938 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 TNA1YGR260W 1605 nt5.01□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 SRP101YDR292C 1866 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 DDC1YPL194W 1839 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 RPL7AYGL076C 735 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 BUD32YGR262C 786 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 ENV9YOR246C 993 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 VMA4YOR332W 702 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 RPL7BYPL198W 735 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 YPR114WYPR114W 948 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 CCZ1YBR131W 2115 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 CDC1YDR182W 1476 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 ACS2YLR153C 2052 nt5□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 VMS1YDR049W 1899 nt4.99□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 CDC34YDR054C 888 nt4.99□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 COX17YLL009C 210 nt4.99□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 RPL10YLR075W 666 nt4.99□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 CAF40YNL288W 1122 nt4.99□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 CAM1YPL048W 1248 nt4.99□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 MDM31YHR194W 1740 nt4.99□□□□□ -1.61
HRD1Q08109 RAD53YPL153C 2466 nt4.99□□□□□ -1.61
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