Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 MHT1YLL062C 975 nt5.54□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.54□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 YNL194CYNL194C 906 nt5.54□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 MRPS12YNR036C 462 nt5.54□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 YCK1YHR135C 1617 nt5.54□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 ERG8YMR220W 1356 nt5.54□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 HIR1YBL008W 2523 nt5.53□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 CLB2YPR119W 1476 nt5.53□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 PRP40YKL012W 1752 nt5.53□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 TEL2YGR099W 2067 nt5.53□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 FPR3YML074C 1236 nt5.53□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 PTC3YBL056W 1407 nt5.53□□□□□ -1.52
SSK1Q07084 IMG1YCR046C 510 nt5.52□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 OM45YIL136W 1182 nt5.52□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 DRE2YKR071C 1047 nt5.52□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 RSA3YLR221C 663 nt5.52□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 GLN1YPR035W 1113 nt5.52□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 IFA38YBR159W 1044 nt5.52□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 MSS116YDR194C 1995 nt5.52□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 YFL042CYFL042C 2025 nt5.52□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 EAF5YEL018W 840 nt5.51□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 VMA4YOR332W 702 nt5.51□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 PRE2YPR103W 864 nt5.51□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 TEP1YNL128W 1305 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 RPT3YDR394W 1287 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 BUR6YER159C 429 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 RPL7AYGL076C 735 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 RPL7BYPL198W 735 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 PAP1YKR002W 1707 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 GUD1YDL238C 1470 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 CDC1YDR182W 1476 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 YDR187CYDR187C 519 nt5.49□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 YLR184WYLR184W 348 nt5.49□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 GAA1YLR088W 1845 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 OSW2YLR054C 2175 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 RRP1YDR087C 837 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 RPS3YNL178W 723 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 ECM2YBR065C 1095 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 IRS4YKR019C 1848 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 ILV1YER086W 1731 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 SUB2YDL084W 1341 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 MSS1YMR023C 1581 nt5.47□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 ICE2YIL090W 1476 nt5.47□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 CUP2YGL166W 678 nt5.47□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 GLC8YMR311C 690 nt5.47□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 YOL079WYOL079W 399 nt5.47□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 YBR027CYBR027C 333 nt5.47□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 PYC1YGL062W 3537 nt5.47□□□□□ -1.53
SSK1Q07084 RAD59YDL059C 717 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 MMS21YEL019C 804 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 RPN11YFR004W 921 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 RPE1YJL121C 717 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 PSR2YLR019W 1194 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 IMD1YAR073W 1212 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YPL136WYPL136W 369 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 AMA1YGR225W 1782 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 PTK2YJR059W 2457 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 WHI2YOR043W 1461 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YMR279CYMR279C 1623 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YLR463CYLR463C 552 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YML018CYML018C 1182 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 NAT5YOR253W 531 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 TAE1YBR261C 699 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 GEX1YCL073C 1848 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 GEX2YKR106W 1848 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YBR138CYBR138C 1575 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 KEX2YNL238W 2445 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 CRZ1YNL027W 2037 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 FAT3YKL187C 2253 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YMR122CYMR122C 375 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 IME2YJL106W 1938 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 DIT1YDR403W 1611 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 GAT1YFL021W 1533 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 ALD6YPL061W 1503 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 KKQ8YKL168C 2175 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SSK22YCR073C 3996 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 DUG1YFR044C 1446 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 PAP2YOL115W 1755 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 MSP1YGR028W 1089 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 BCY1YIL033C 1251 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YJR084WYJR084W 1272 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 GLE1YDL207W 1617 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 TKL1YPR074C 2043 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 RPN5YDL147W 1338 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 UIP5YKR044W 1332 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 GPT2YKR067W 2232 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 MSN2YMR037C 2115 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 IMA2YOL157C 1770 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 CLB1YGR108W 1416 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 SDH4YDR178W 546 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 PIC2YER053C 903 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK1Q07084 YGR291CYGR291C 222 nt5.42□□□□□ -1.54
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