Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHRNDQ07001 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNDQ07001 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNDQ07001 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNDQ07001 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms