Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBQ06643 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBQ06643 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBQ06643 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBQ06643 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBQ06643 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBQ06643 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBQ06643 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBQ06643 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBQ06643 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBQ06643 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBQ06643 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBQ06643 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBQ06643 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBQ06643 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBQ06643 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBQ06643 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBQ06643 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBQ06643 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBQ06643 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LTBQ06643 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBQ06643 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBQ06643 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBQ06643 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBQ06643 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBQ06643 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBQ06643 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBQ06643 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBQ06643 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBQ06643 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBQ06643 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBQ06643 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBQ06643 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBQ06643 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBQ06643 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBQ06643 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBQ06643 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBQ06643 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBQ06643 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBQ06643 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBQ06643 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBQ06643 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBQ06643 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBQ06643 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBQ06643 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBQ06643 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBQ06643 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBQ06643 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBQ06643 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBQ06643 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBQ06643 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBQ06643 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBQ06643 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBQ06643 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBQ06643 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms