Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCZQ05513 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCZQ05513 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PRKCZQ05513 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCZQ05513 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms