Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SSBP1Q04837 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP1Q04837 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms