Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX5Q02548 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX5Q02548 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX5Q02548 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms