Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 QCR6YFR033C 444 nt7.38□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 SMK1YPR054W 1167 nt7.38□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 YBR144CYBR144C 315 nt7.38□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 YBR226CYBR226C 411 nt7.38□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 ECM38YLR299W 1983 nt7.38□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 MKK1YOR231W 1527 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 CIT3YPR001W 1461 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 ARP3YJR065C 1350 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 FZF1YGL254W 900 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 YGR022CYGR022C 330 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 MRP17YKL003C 396 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 YPL071CYPL071C 471 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 YPR204WYPR204W 3099 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 PYC2YBR218C 3543 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 BDF2YDL070W 1917 nt7.37□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 snR78snR78 87 nt7.36□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 RRP4YHR069C 1080 nt7.36□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 PAN6YIL145C 930 nt7.36□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 DJP1YIR004W 1299 nt7.36□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 EDC3YEL015W 1656 nt7.35□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 CTF8YHR191C 402 nt7.35□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 SKG1YKR100C 1068 nt7.35□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt7.34□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 YDL114WYDL114W 927 nt7.34□□□□□ -1.23
CTF4Q01454 CNE1YAL058W 1509 nt7.33□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 ADY2YCR010C 852 nt7.33□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 PET112YBL080C 1626 nt7.33□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 YGL036WYGL036W 2730 nt7.33□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 JIP4YDR475C 2631 nt7.32□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 AMD1YML035C 2433 nt7.32□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 YCR099CYCR099C 468 nt7.32□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 VTS1YOR359W 1572 nt7.32□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 YPL041CYPL041C 624 nt7.31□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 APE3YBR286W 1614 nt7.3□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 YDR278CYDR278C 318 nt7.3□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 VRP1YLR337C 2454 nt7.3□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 AGP2YBR132C 1791 nt7.3□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 CDC16YKL022C 2523 nt7.3□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 FRS2YFL022C 1512 nt7.29□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 GON7YJL184W 372 nt7.29□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 YKL031WYKL031W 414 nt7.29□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 MOD5YOR274W 1287 nt7.29□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 IFA38YBR159W 1044 nt7.29□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 GLE1YDL207W 1617 nt7.29□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 ICL2YPR006C 1728 nt7.29□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 HXT15YDL245C 1704 nt7.28□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 HXT16YJR158W 1704 nt7.28□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 ARP2YDL029W 1176 nt7.28□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 ARG1YOL058W 1263 nt7.28□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 RPS9AYPL081W 594 nt7.28□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 YBR124WYBR124W 360 nt7.28□□□□□ -1.24
CTF4Q01454 MRPL1YDR116C 858 nt7.27□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 GIR2YDR152W 798 nt7.27□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 EFM4YIL064W 774 nt7.27□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 DUS4YLR405W 1104 nt7.27□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 NMT1YLR195C 1368 nt7.27□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 ARG81YML099C 2643 nt7.27□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 YCL065WYCL065W 369 nt7.26□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 YRA1YDR381W 681 nt7.26□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 YNR068CYNR068C 819 nt7.26□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 ARR3YPR201W 1215 nt7.26□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 YDR109CYDR109C 2148 nt7.25□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 GIT1YCR098C 1557 nt7.25□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 DCN1YLR128W 810 nt7.25□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 PKC1YBL105C 3456 nt7.25□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 DAL3YIR032C 588 nt7.24□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 ICS3YJL077C 396 nt7.24□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 LST8YNL006W 912 nt7.24□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 YNR040WYNR040W 771 nt7.24□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 YOL163WYOL163W 510 nt7.24□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 RPN7YPR108W 1290 nt7.24□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 SHM1YBR263W 1473 nt7.24□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 COG1YGL223C 1254 nt7.23□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 YJU3YKL094W 942 nt7.23□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 URE2YNL229C 1065 nt7.23□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 MRPL36YBR122C 534 nt7.23□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 NUD1YOR373W 2556 nt7.23□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 VID30YGL227W 2877 nt7.22□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 YME1YPR024W 2244 nt7.22□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 APS3YJL024C 585 nt7.22□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 ERP2YAL007C 648 nt7.22□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 NPA3YJR072C 1158 nt7.22□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 MRPL13YKR006C 795 nt7.22□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 CAR1YPL111W 1002 nt7.22□□□□□ -1.25
CTF4Q01454 LYS12YIL094C 1116 nt7.21□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 GAA1YLR088W 1845 nt7.21□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 YER010CYER010C 705 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 SUP2tY(GUA)D 75 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 SUP11tY(GUA)F1 75 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 SUP6tY(GUA)F2 75 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 SUP7tY(GUA)J1 75 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 SUP4tY(GUA)J2 75 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 SUP5tY(GUA)M1 75 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 SUP8tY(GUA)M2 75 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 SUP3tY(GUA)O 75 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 MEU1YLR017W 1014 nt7.2□□□□□ -1.26
CTF4Q01454 CSG2YBR036C 1233 nt7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms