Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSG4Q00888 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSG4Q00888 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSG4Q00888 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms