Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK17Q00537 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK17Q00537 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK17Q00537 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms