Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC5Q00444 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC5Q00444 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXC5Q00444 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXC5Q00444 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms