Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB4BP68371 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB4BP68371 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms