Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RACK1P63244 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RACK1P63244 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RACK1P63244 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RACK1P63244 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RACK1P63244 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RACK1P63244 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RACK1P63244 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RACK1P63244 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RACK1P63244 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RACK1P63244 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RACK1P63244 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RACK1P63244 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RACK1P63244 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RACK1P63244 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RACK1P63244 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RACK1P63244 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RACK1P63244 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RACK1P63244 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RACK1P63244 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RACK1P63244 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RACK1P63244 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RACK1P63244 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RACK1P63244 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RACK1P63244 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RACK1P63244 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RACK1P63244 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RACK1P63244 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RACK1P63244 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RACK1P63244 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RACK1P63244 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RACK1P63244 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RACK1P63244 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RACK1P63244 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RACK1P63244 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RACK1P63244 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RACK1P63244 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RACK1P63244 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RACK1P63244 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RACK1P63244 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RACK1P63244 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RACK1P63244 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RACK1P63244 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RACK1P63244 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RACK1P63244 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RACK1P63244 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RACK1P63244 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RACK1P63244 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RACK1P63244 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RACK1P63244 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RACK1P63244 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RACK1P63244 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RACK1P63244 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RACK1P63244 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RACK1P63244 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RACK1P63244 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RACK1P63244 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RACK1P63244 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RACK1P63244 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms