Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKP1P63208 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKP1P63208 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKP1P63208 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKP1P63208 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKP1P63208 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SKP1P63208 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SKP1P63208 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKP1P63208 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKP1P63208 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKP1P63208 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKP1P63208 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKP1P63208 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKP1P63208 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKP1P63208 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKP1P63208 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SKP1P63208 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKP1P63208 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKP1P63208 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKP1P63208 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKP1P63208 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKP1P63208 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKP1P63208 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKP1P63208 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKP1P63208 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKP1P63208 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKP1P63208 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKP1P63208 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKP1P63208 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKP1P63208 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKP1P63208 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKP1P63208 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SKP1P63208 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKP1P63208 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKP1P63208 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKP1P63208 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKP1P63208 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKP1P63208 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKP1P63208 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKP1P63208 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKP1P63208 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKP1P63208 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKP1P63208 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKP1P63208 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKP1P63208 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKP1P63208 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKP1P63208 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKP1P63208 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKP1P63208 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKP1P63208 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms