Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P63121 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms