Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH11P55287 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH11P55287 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH11P55287 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH11P55287 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH11P55287 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH11P55287 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH11P55287 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH11P55287 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH11P55287 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDH11P55287 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH11P55287 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH11P55287 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH11P55287 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH11P55287 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH11P55287 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH11P55287 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH11P55287 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH11P55287 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH11P55287 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH11P55287 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH11P55287 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH11P55287 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDH11P55287 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH11P55287 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH11P55287 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH11P55287 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH11P55287 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH11P55287 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDH11P55287 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH11P55287 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH11P55287 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH11P55287 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH11P55287 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDH11P55287 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH11P55287 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH11P55287 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDH11P55287 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH11P55287 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH11P55287 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH11P55287 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH11P55287 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH11P55287 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH11P55287 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH11P55287 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH11P55287 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH11P55287 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH11P55287 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH11P55287 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH11P55287 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH11P55287 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH11P55287 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH11P55287 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH11P55287 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH11P55287 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH11P55287 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH11P55287 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH11P55287 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH11P55287 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH11P55287 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH11P55287 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH11P55287 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH11P55287 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH11P55287 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms