Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP9P55211 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP9P55211 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP9P55211 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP9P55211 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP9P55211 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP9P55211 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP9P55211 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP9P55211 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP9P55211 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP9P55211 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP9P55211 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP9P55211 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP9P55211 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP9P55211 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP9P55211 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP9P55211 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP9P55211 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP9P55211 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP9P55211 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP9P55211 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP9P55211 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP9P55211 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP9P55211 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP9P55211 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP9P55211 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP9P55211 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP9P55211 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP9P55211 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP9P55211 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP9P55211 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP9P55211 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP9P55211 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP9P55211 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP9P55211 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP9P55211 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP9P55211 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP9P55211 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP9P55211 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP9P55211 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP9P55211 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP9P55211 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP9P55211 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP9P55211 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP9P55211 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP9P55211 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP9P55211 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP9P55211 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP9P55211 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP9P55211 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP9P55211 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP9P55211 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP9P55211 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP9P55211 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP9P55211 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP9P55211 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP9P55211 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP9P55211 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP9P55211 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP9P55211 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP9P55211 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP9P55211 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP9P55211 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP9P55211 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP9P55211 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP9P55211 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP9P55211 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP9P55211 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP9P55211 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP9P55211 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP9P55211 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP9P55211 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP9P55211 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP9P55211 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP9P55211 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP9P55211 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP9P55211 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP9P55211 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP9P55211 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP9P55211 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP9P55211 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP9P55211 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP9P55211 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP9P55211 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms