Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELLP55199 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELLP55199 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELLP55199 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELLP55199 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELLP55199 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELLP55199 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELLP55199 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELLP55199 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELLP55199 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELLP55199 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELLP55199 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ELLP55199 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELLP55199 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELLP55199 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELLP55199 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELLP55199 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ELLP55199 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELLP55199 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELLP55199 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELLP55199 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELLP55199 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELLP55199 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELLP55199 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELLP55199 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELLP55199 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELLP55199 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELLP55199 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELLP55199 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ELLP55199 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELLP55199 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELLP55199 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELLP55199 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELLP55199 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELLP55199 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELLP55199 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELLP55199 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELLP55199 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELLP55199 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELLP55199 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELLP55199 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELLP55199 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELLP55199 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELLP55199 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELLP55199 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELLP55199 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELLP55199 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELLP55199 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELLP55199 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELLP55199 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELLP55199 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms