Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-5P52952 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms