Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB28P51157 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB28P51157 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB28P51157 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB28P51157 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB28P51157 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB28P51157 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB28P51157 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB28P51157 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB28P51157 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB28P51157 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB28P51157 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB28P51157 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB28P51157 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB28P51157 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB28P51157 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB28P51157 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB28P51157 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB28P51157 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB28P51157 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB28P51157 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB28P51157 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB28P51157 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB28P51157 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB28P51157 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB28P51157 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB28P51157 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB28P51157 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB28P51157 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB28P51157 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB28P51157 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB28P51157 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB28P51157 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB28P51157 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB28P51157 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB28P51157 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB28P51157 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB28P51157 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB28P51157 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB28P51157 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB28P51157 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB28P51157 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB28P51157 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB28P51157 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB28P51157 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB28P51157 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB28P51157 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB28P51157 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB28P51157 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB28P51157 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB28P51157 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB28P51157 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB28P51157 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB28P51157 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB28P51157 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB28P51157 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB28P51157 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB28P51157 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB28P51157 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB28P51157 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB28P51157 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB28P51157 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB28P51157 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB28P51157 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB28P51157 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB28P51157 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB28P51157 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB28P51157 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB28P51157 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB28P51157 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB28P51157 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB28P51157 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB28P51157 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB28P51157 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB28P51157 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB28P51157 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB28P51157 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB28P51157 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB28P51157 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB28P51157 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB28P51157 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB28P51157 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB28P51157 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB28P51157 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB28P51157 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB28P51157 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB28P51157 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB28P51157 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB28P51157 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms