Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144AP50876 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144AP50876 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144AP50876 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144AP50876 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144AP50876 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF144AP50876 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF144AP50876 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF144AP50876 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF144AP50876 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF144AP50876 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms