Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB3P49720 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMB3P49720 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB3P49720 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms