Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP4P49662 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP4P49662 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP4P49662 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP4P49662 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP4P49662 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP4P49662 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP4P49662 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP4P49662 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP4P49662 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP4P49662 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP4P49662 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP4P49662 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP4P49662 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP4P49662 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP4P49662 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP4P49662 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP4P49662 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP4P49662 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP4P49662 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP4P49662 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP4P49662 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP4P49662 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP4P49662 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP4P49662 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP4P49662 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASP4P49662 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP4P49662 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP4P49662 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP4P49662 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP4P49662 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP4P49662 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASP4P49662 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP4P49662 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP4P49662 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP4P49662 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP4P49662 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP4P49662 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASP4P49662 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP4P49662 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP4P49662 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP4P49662 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP4P49662 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP4P49662 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP4P49662 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASP4P49662 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP4P49662 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP4P49662 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP4P49662 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP4P49662 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASP4P49662 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP4P49662 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP4P49662 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP4P49662 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP4P49662 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP4P49662 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP4P49662 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP4P49662 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASP4P49662 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP4P49662 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP4P49662 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP4P49662 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP4P49662 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP4P49662 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASP4P49662 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP4P49662 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP4P49662 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP4P49662 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP4P49662 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP4P49662 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP4P49662 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASP4P49662 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP4P49662 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP4P49662 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CASP4P49662 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CASP4P49662 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP4P49662 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP4P49662 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP4P49662 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP4P49662 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP4P49662 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP4P49662 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP4P49662 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP4P49662 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP4P49662 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP4P49662 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP4P49662 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP4P49662 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP4P49662 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP4P49662 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP4P49662 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP4P49662 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP4P49662 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP4P49662 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP4P49662 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms