Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX2P48431 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX2P48431 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX2P48431 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX2P48431 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX2P48431 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX2P48431 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX2P48431 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX2P48431 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX2P48431 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX2P48431 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX2P48431 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOX2P48431 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOX2P48431 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOX2P48431 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOX2P48431 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOX2P48431 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SOX2P48431 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOX2P48431 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX2P48431 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX2P48431 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX2P48431 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX2P48431 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX2P48431 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX2P48431 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX2P48431 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX2P48431 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX2P48431 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX2P48431 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX2P48431 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX2P48431 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX2P48431 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX2P48431 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX2P48431 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX2P48431 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX2P48431 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX2P48431 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX2P48431 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX2P48431 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX2P48431 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX2P48431 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX2P48431 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX2P48431 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX2P48431 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOX2P48431 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms