Protein–RNA interactions for Protein: P47976

CTH1, mRNA decay factor CTH1, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTH1P47976 MEH1YKR007W 555 nt7.54□□□□□ -1.2
CTH1P47976 CSI1YMR025W 888 nt7.54□□□□□ -1.2
CTH1P47976 DFR1YOR236W 636 nt7.54□□□□□ -1.2
CTH1P47976 OSW1YOR255W 837 nt7.54□□□□□ -1.2
CTH1P47976 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.54□□□□□ -1.2
CTH1P47976 PEX31YGR004W 1389 nt7.54□□□□□ -1.2
CTH1P47976 IME2YJL106W 1938 nt7.54□□□□□ -1.2
CTH1P47976 SIR2YDL042C 1689 nt7.54□□□□□ -1.2
CTH1P47976 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.53□□□□□ -1.2
CTH1P47976 SLX1YBR228W 915 nt7.53□□□□□ -1.2
CTH1P47976 YCL041CYCL041C 495 nt7.53□□□□□ -1.2
CTH1P47976 ILV1YER086W 1731 nt7.52□□□□□ -1.2
CTH1P47976 SKY1YMR216C 2229 nt7.52□□□□□ -1.2
CTH1P47976 EEB1YPL095C 1371 nt7.52□□□□□ -1.21
CTH1P47976 MRPL13YKR006C 795 nt7.52□□□□□ -1.21
CTH1P47976 MSA2YKR077W 1092 nt7.52□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YMR114CYMR114C 1107 nt7.52□□□□□ -1.21
CTH1P47976 AAD15YOL165C 432 nt7.52□□□□□ -1.21
CTH1P47976 ECM27YJR106W 2178 nt7.52□□□□□ -1.21
CTH1P47976 PUS7YOR243C 2031 nt7.51□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.51□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YLR194CYLR194C 765 nt7.51□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YOL107WYOL107W 1029 nt7.51□□□□□ -1.21
CTH1P47976 SUT2YPR009W 807 nt7.51□□□□□ -1.21
CTH1P47976 MRPS5YBR251W 924 nt7.51□□□□□ -1.21
CTH1P47976 MCM5YLR274W 2328 nt7.51□□□□□ -1.21
CTH1P47976 EDE1YBL047C 4146 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 ARP3YJR065C 1350 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 NUF2YOL069W 1356 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 HEM1YDR232W 1647 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 MAF1YDR005C 1188 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 CTF8YHR191C 402 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YHC3YJL059W 1227 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YMR010WYMR010W 1218 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 PEX12YMR026C 1200 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YNL120CYNL120C 486 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YNL165WYNL165W 1221 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 PRI2YKL045W 1587 nt7.5□□□□□ -1.21
CTH1P47976 PUS9YDL036C 1389 nt7.49□□□□□ -1.21
CTH1P47976 MDH3YDL078C 1032 nt7.49□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.49□□□□□ -1.21
CTH1P47976 RMA1YKL132C 1293 nt7.49□□□□□ -1.21
CTH1P47976 RGT2YDL138W 2292 nt7.49□□□□□ -1.21
CTH1P47976 PYK2YOR347C 1521 nt7.48□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.48□□□□□ -1.21
CTH1P47976 QCR6YFR033C 444 nt7.48□□□□□ -1.21
CTH1P47976 PRM10YJL108C 1152 nt7.48□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YJL211CYJL211C 444 nt7.48□□□□□ -1.21
CTH1P47976 GCN3YKR026C 918 nt7.48□□□□□ -1.21
CTH1P47976 IDI1YPL117C 867 nt7.48□□□□□ -1.21
CTH1P47976 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt7.47□□□□□ -1.21
CTH1P47976 MIA40YKL195W 1212 nt7.47□□□□□ -1.21
CTH1P47976 snR34snR34 203 nt7.47□□□□□ -1.21
CTH1P47976 RER1YCL001W 567 nt7.47□□□□□ -1.21
CTH1P47976 HAS1YMR290C 1518 nt7.47□□□□□ -1.21
CTH1P47976 LDS1YAL018C 978 nt7.46□□□□□ -1.22
CTH1P47976 CCP1YKR066C 1086 nt7.46□□□□□ -1.22
CTH1P47976 IRC14YOR135C 342 nt7.46□□□□□ -1.22
CTH1P47976 snR189snR189 189 nt7.46□□□□□ -1.22
CTH1P47976 YPR150WYPR150W 522 nt7.46□□□□□ -1.22
CTH1P47976 MCH1YDL054C 1461 nt7.46□□□□□ -1.22
CTH1P47976 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.45□□□□□ -1.22
CTH1P47976 YPR204WYPR204W 3099 nt7.45□□□□□ -1.22
CTH1P47976 CDC34YDR054C 888 nt7.44□□□□□ -1.22
CTH1P47976 LST8YNL006W 912 nt7.44□□□□□ -1.22
CTH1P47976 CLN1YMR199W 1641 nt7.44□□□□□ -1.22
CTH1P47976 YGR283CYGR283C 1026 nt7.43□□□□□ -1.22
CTH1P47976 YJR107WYJR107W 987 nt7.43□□□□□ -1.22
CTH1P47976 OCA1YNL099C 717 nt7.43□□□□□ -1.22
CTH1P47976 TOS6YNL300W 309 nt7.43□□□□□ -1.22
CTH1P47976 MCT1YOR221C 1083 nt7.43□□□□□ -1.22
CTH1P47976 RRS1YOR294W 612 nt7.43□□□□□ -1.22
CTH1P47976 MDM31YHR194W 1740 nt7.43□□□□□ -1.22
CTH1P47976 GEF1YJR040W 2340 nt7.43□□□□□ -1.22
CTH1P47976 RAI1YGL246C 1164 nt7.42□□□□□ -1.22
CTH1P47976 YKL031WYKL031W 414 nt7.42□□□□□ -1.22
CTH1P47976 ACO1YLR304C 2337 nt7.42□□□□□ -1.22
CTH1P47976 ERG12YMR208W 1332 nt7.42□□□□□ -1.22
CTH1P47976 AGP2YBR132C 1791 nt7.41□□□□□ -1.22
CTH1P47976 ARG81YML099C 2643 nt7.41□□□□□ -1.22
CTH1P47976 CWC25YNL245C 540 nt7.41□□□□□ -1.22
CTH1P47976 PRE2YPR103W 864 nt7.41□□□□□ -1.22
CTH1P47976 PZF1YPR186C 1290 nt7.41□□□□□ -1.22
CTH1P47976 GLN3YER040W 2193 nt7.41□□□□□ -1.22
CTH1P47976 NUR1YDL089W 1455 nt7.41□□□□□ -1.22
CTH1P47976 ADE17YMR120C 1779 nt7.41□□□□□ -1.22
CTH1P47976 LEU5YHR002W 1074 nt7.4□□□□□ -1.22
CTH1P47976 IDP3YNL009W 1263 nt7.4□□□□□ -1.22
CTH1P47976 ARR3YPR201W 1215 nt7.4□□□□□ -1.22
CTH1P47976 AFG1YEL052W 1530 nt7.39□□□□□ -1.23
CTH1P47976 HAT2YEL056W 1206 nt7.39□□□□□ -1.23
CTH1P47976 YLR169WYLR169W 354 nt7.39□□□□□ -1.23
CTH1P47976 NMD4YLR363C 657 nt7.39□□□□□ -1.23
CTH1P47976 ECM30YLR436C 3825 nt7.39□□□□□ -1.23
CTH1P47976 DSE3YOR264W 1293 nt7.39□□□□□ -1.23
CTH1P47976 TKL2YBR117C 2046 nt7.39□□□□□ -1.23
CTH1P47976 GAA1YLR088W 1845 nt7.38□□□□□ -1.23
CTH1P47976 FPR2YDR519W 408 nt7.38□□□□□ -1.23
CTH1P47976 ERG29YMR134W 714 nt7.38□□□□□ -1.23
CTH1P47976 VTS1YOR359W 1572 nt7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.7 ms