Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRB2P47870 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRB2P47870 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRB2P47870 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRB2P47870 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms