Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEDD4P46934 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD4P46934 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD4P46934 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms